Em termos gerais, Ecologia é o estudo científico de como os organismos interagem uns com os outros e com o seu ambiente. A Ecologia Aquática inclui o estudo destas relações em todos os ambientes aquáticos, incluindo oceanos, estuários, lagos, lagoas, pântanos, rios e ribeiros.
Um ecossistema é uma comunidade de organismos vivos e o seu ambiente físico e químico, ligados por fluxos de energia e nutrientes. Os ecossistemas funcionam como uma unidade ecológica distinta e podem ser definidos em uma variedade de escalas. Por exemplo, a bacia fluvial do rio Limpopo pode ser considerada um ecossistema assim como o pode ser uma lagoa pequena, um tronco, ou o planeta inteiro. As fronteiras de um ecossistema aquático são algo arbitrárias mas geralmente incluem uma região na qual as entradas e saídas podem ser estimadas. Os ecologistas dos ecossistemas estudam o modo como os nutrientes, a energia e a água fluem através de um ecossistema.
As características físicas dos habitats aquáticos afectam tanto o tipo como a variedade de organismos (Biodiversidade) encontrados. Os organismos em um determinado ambiente são directamente afectados pelas suas características, tais como concentrações de nutrientes, temperatura, fluxo de água e abrigo. Apenas os que se adaptam melhor a estas condições e os mais capazes de utilizar os recursos disponíveis irão desenvolver-se. A interacção entre organismos é igualmente relevante, uma vez que a predação e competição pelos recursos (p. ex., alimento e habitat) afectam a abundância das espécies e a sua diversidade. Por sua vez, os organismos em um ambiente podem influenciar alguns aspectos desse seu ambiente.
A compreensão dos ecossistemas aquáticos e a interacção entre os organismos e o seu ambiente podem contribuir para uma melhor gestão dos efeitos humanos. Os tópicos chave que serão discutidos nesta secção incluem:

Árvore Mashatu.
Fonte: Hatfield 2010
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Resumo do Capítulo
Este capítulo cobre os seguintes conceitos e matérias: